A Magyar Egészségügyi Szakdolgozói Kamara – struktúráját tekintve – alulról épült fel, amely azt jelenti, hogy településeken és a fővárosi kerületekben helyi szervezetek jöttek létre a MESZK Törvényben meghatározott létszámok figyelembe vétele alapján. A jelenleg működő 85 helyi szervezet önálló képviseleti és ügyintéző szervvel rendelkező testület, de nem önálló jogi személy. A helyi szervezeteket minden megyében és a fővárosban is úgynevezett területi szervezet fogja össze, amely ugyancsak képviseleti és ügyintéző, költségvetéssel rendelkező szervezetként működik. A MESZK mind a 20 területi szervezete önálló jogi személy. A területi szervezetekhez szorosan kapcsolódnak a szakmai tagozatok. A Törvény és az Alapszabály értelmében 21 tagozat fejtheti ki tevékenységét. Amennyiben legalább 3 területen működik az adott szakmai tagozat, ezt követően létrejöhet az országos képviselete is. Jelenleg 21 szakmai tagozatnak jött létre országos szinten is képviselete. A Kamara felépítésében a területi és azon keresztül a helyi szervezetek működését az országos szervezet fogja össze.
